Лаборатория эпидемиологически и социально значимых инфекций
Руководитель лаборатории
доктор медицинских наук Огарков Олег Борисович
Лаборатория организована более 30 лет назад, проф. Савиловым Е.Д. в качестве лаборатории «Эпидемиологии антропонозных инфекций». Основное направление деятельности подразделения эпидемиологические и микробиологические исследования актуальных инфекций от популяционного уровня, до уровня отдельных организмов. Под руководством Е.Д. Савилова, на базе лаборатории защищено более 40 кандидатских и 15 докторских диссертаций по специальности «эпидемиология» или «микробиология». В настоящее время возглавляет лабораторию и отдел Эпидемиологии и микробиологии один из учеников проф. Савилова Е.Д. — д.м.н. О.Б. Огарков.
Перспективными направлениями исследований сотрудников лаборатории являются:
Помимо традиционных для лаборатории направлений — «эпидемиология социально-значимых инфекций» и «молекулярная эпидемиология туберкулеза», коллективом лаборатории проводятся исследования по ряду перспективных направлений, таких как, «исследование фармакокинетики протвотуберкулезных препаратов» (совместно с Медицинской школой Университета Вирджинии, США), «поиск новых биомаркеров актуальных инфекционных заболеваний методами полногеномного секвенирования», «исследования микробиом легких при туберкулезном процессе».
Поддержка исследований (гранты, конкурсы):
- РФФИ международный 2017-2019 «Персонализированный подход в борьбе с эпидемией ВИЧ/туберкулеза с лекарственной устойчивостью в Иркутске, Сибирь»;
- РФФИ 2017-2018 «Сравнительное исследование процесса образования биофильмов у различных генотипов Mycobacterium tuberculosis в моно- и микст-культурах»;
- РФФИ 2015-2017 «Анализ генетического полиморфизма Mycobacterium tuberculosis от больных из контрастных возрастных групп для реконструкции распространения субтипа MIT17 пандемического генотипа Пекин в Восточной Сибири и Саха (Якутии) в ХХ веке»;
- РФФИ международный 2013-2014 «Исследование движущих сил эпидемии ВИЧ/МЛУ-ТБ: роль генотипов возбудителя туберкулеза и измененной фармакокинетики антиретровирусных и противотуберкулезных препаратов у больных из Восточной Сибири»;
- РФФИ 2013-2015 «Идентификация SNPs специфических для мало-вирулентных генотипов Mycobacterium tuberculosis методом геномного секвенирования»;
- 2012-2013 молодежный «Исследование филогенетических взаимоотношений основных генотипов Mycobacterium tuberculosis по 24 локусам MIRU-VNTR для реконструкции истории эпидемий туберкулеза в прошлом и настоящем на территории Якутии, Бурятии и Иркутской области»;
- NIH, US 2017-2019 Diagnostics and Pharmacotherapy for Severe Forms of TB;
- NIH, US 2014-2016 MD-INMD Genotyping and Pharmacokinetics in the HIV/MDR-TB epidemic of Eastern Siberia.
Наши разработки и объекты интеллектуальной собственности
-
Заявка на международный патент № 201700085/26 в Евразийскую патентную организацию «Олигонуклеотидные праймеры, флуоресцентные ДНК-зонды и способ выявления Mycobacterium tuberculosis клонального комплекса 2-W 148 генотипа Beijing в клинических образцах».
Сотрудничество с российскими и зарубежными организациями:
- Иркутская областная клиническая туберкулезная больница;
- Иркутская областная детская туберкулезная больница;
- Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН, Оренбург;
- Медицинская Школа Университета Вирджинии, США.
Докторские диссертации:
- В 2018 г Ждановой С.Н. защищена докторская диссертация «Молекулярно-эпидемиологическое исследование распространения основных генотипов возбудителя туберкулеза в Северной Азии».
Выполняемые докторские и кандидатские диссертации:
- м.н.с. Хромова П.А. выполняет кандидатскую диссертацию «Исследование влияния генотипов возбудителя туберкулеза и пациента на исход туберкулеза легких»;
- с.н.с. Синьков В.В. выполняет докторскую диссертацию по теме, связанной с применением полногеномного секвенирования и биоинформационного анализа в микробиологии и эпидемиологии туберкулезной инфекции.
Повышение квалификации:
В лаборатории большинство научных сотрудников имеет сертификаты специалистов по специальностям «эпидемиология», «микробиология» и «лабораторная диагностика». Ряд сотрудников имеет сертификаты по двум из вышеперечисленных специальностей.
В настоящее время в лаборатории работают:
Штатные сотрудники:
- Савилов Евгений Дмитриевич, проф., д.м.н., г.н.с.;
- Жданова Светлана Николаевна, д.м.н., в.н.с.;
- Хромова Полина Андреевна, м.н.с.;
- Синьков Вячеслав Владимирович, к.м.н., с.н.с;
Совместители:
- Савченков Михаил Федосович, проф. д.м.н., акад. РАН;
- Чемезова Наталья Николаевна, к.м.н., н.с;