Лаборатория микробиома и микроэкологии

Руководитель:
кандидат биологических наук Белькова Наталья Леонидовна

В лаборатории ведутся исследования в области микробиома и микробной экологии человека. Сотрудниками лаборатории накоплен значительный материал по микроэкологическим характеристикам разных биотопов у детей, проживающих в регионе, обозначены региональные ориентиры количественных и качественных характеристик представителей индигенной микрофлоры имеется достаточный задел по геновидовому типированию и вариациям видовой сочетаемости бифидобактерий в кишечном биотопе детей разных возрастов, исследована эволюция патогенного потенциала условно-патогенной микробиоты, выделенной из разных биотопов человека. В лаборатории ведутся исследования по изучению реакций системного и мукозального иммунного ответа к антигенам бифидо- и лактобактерий в норме и при дисбиотических состояний. Изучена популяционная иммунореактивность к бифидобактериям при разных уровнях техногенной нагрузки. Дальнейшие исследования в этом направлении могут послужить обоснованием к раскрытию одного из возможных механизмов, способствующих устойчивому сохранению дисбиотических состояний, на основании иммунологической толерантности к индигенной микрофлоре. Для данных исследований конструируются иммунодиагностикумы с использованием нанокомпозитных соединений (Патенты РФ).

Бюджетная тема лаборатории: «Изучение фундаментальных основ и закономерностей эпидемического процесса социально-значимых и природно-очаговых инфекций в Восточной Сибири и сопредельных территориях». Сроки выполнения: 2013- 2015 гг. Лабораторией ведется коммерческая деятельность по оказанию услуг населению: диагностика микроэкологических нарушений различных биотопов человека (носоглоточный, кишечный, вагинальный). На базе лаборатории осуществляется обучение студентов (Иркутский государственный университет, Иркутский государственный медицинский университет) навыкам научно-практической работы. В рамках научной тематики выполняются курсовые и дипломные работы.

В настоящее время лаборатория выполняет следующие задачи:

• Проведение исследований по выявлению значимости состояния микробной экологии человека для его здоровья и риска развития инфекционных и соматических заболеваний.
• Разработка методических приемов для проведения экспериментальных исследований в области микроэкологии.
• Молекулярно-генетическая идентификация региональных штаммов симбионтов человека.
• Изучение взаимоформирования микрофлоры слизистых оболочек открытых полостей различных биотопов у женщин как важный фактор их репродуктивного здоровья.
• Оценка патогенного потенциала у аутоштаммов Escherichia coli и Klebsiella spp. с помощью молекулярно-генетических методов.
• Оценка микробиоценоза кишечника у детей с функциональными нарушениями желудочно-кишечного такта.
• Выявление антигенов Helicobacter pylori у детей и подростков.
• Проводится постоянная работа по совершенствованию базы микробиологических данных, позволяющих получить региональные ориентиры микробной экологии человека.
• Проводится разработка методов молекулярно-генетического мониторинга различных гастроэнтерологических нарушений, включающего в себя определение комплекса генетических маркеров факторов патогенности в аутоштаммах Escherichia coli и Klebsiella spp. у детей.

Сотрудничество с российскими и зарубежными организациями

Лаборатория имеет многолетние научные контакты с организациями Российской академии наук: Иркутским институтом химии им. Э.А Фаворского СО РАН, Лимнологическим институтом СО РАН, а также Иркутским государственным медицинским университетом и Иркутским госуниверситетом.

Наши разработки и объекты интеллектуальной собственности:

Патенты

• Патент на изобретение № 2423709 от 10.07.2011 «Способ определения специфических антител в копрофильтратах», авторы: Лещук С.И., Попкова С.М., Сердюк Л.В.
• Патент на изобретение № 2429483 от 20.09.2011 «Способ получения эритроцитарного антигенного диагностикума», авторы: Лещук С.И., Даниловцева Е.Н., Сердюк Л.В., Попкова С.М., Анненков В.В.

Базы данных

• Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2011620075 от 30.11.2010 «Микроэкологический пейзаж вагинального и кишечного биотопов у женщин и девочек-подростков города Иркутска, авторы: Попкова С.М., Кичигина Е.Л., Храмова Е.Е., Сутурина Л.В., Шабанова Н.М., Немченко У.М., Пигарева Л.Н.
• Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2014621244 от 04.09.2014 «Микроэкологическая структура кишечного биоценоза с видовой характеристикой бифидобактерий у детей г. Иркутска», авторы: Попкова С.М., Кичигина Е.Л., Ракова Е.Б., Немченко У.М., Джиоев Ю.П., Савелькаева М.В.

Кандидатские диссертации:

• Иванова Елена Иннокентьевна (кандидат биологических наук) на тему: «Формирование патогенного потенциала у аутоштаммов Escherichia coli в ассоциативном симбиозе толстой кишки у детей с функциональными нарушениями желудочно-кишечного тракта»
• Ракова Елена Борисовна (кандидат биологических наук) на тему: «Современная структура кишечного микробиоценоза у детского населения Иркутской области»
• Немченко Ульяна Михайловна (кандидат биологических наук) на тему: "Микроэкологический статус кишечного биоценоза и видовая архитектоника бифидобактерий у детей"
• Сердюк Людмила Викторовна (кандидат биологических наук) на тему: «Способы повышения эффективности эритроцитарных диагностикумов для оценки иммунореактивности организма в реакции пассивной гемагглютинации»

Выполняемые кандидатские диссертации:

• Шабанова Наталья Михайловна на тему: «Особенности формирования ассоциаций и генетического профиля микробов-симбионтов и условно-патогенной микрофлоры у девочек-подростков с нарушениями репродуктивной сферы»
• Бухарова Екатерина Владимировна на тему: «Особенности формирования патогенного потенциала у региональных популяций Klebsiella spp., выделенных от детей первого года жизни с функциональными нарушениями желудочно-кишечного тракта»
• Кунгурцева Екатерина Александровна на тему: «Особенности взаимовлияния ассоциативной микрофлоры слизистых оболочек смежных биотопов у женщин c репродуктивными нарушениями»

Повышение квалификации:

• Иванова Е.И. – Удостоверение о повышении квалификации (регистрационный номер 0643) в ГБОУ ДПО ИГМАПО Минздрава России по программе ОУ «Бактериология» (от 17.03.2015);
• Бухарова Е.В. – Удостоверение о повышении квалификации (регистрационный номер 613) в ГБОУ ДПО ИГМАПО Минздрава России по программе ОУ «Бактериология» (от 17.03.2012);
• Немченко У.М. – Удостоверение о повышении квалификации (регистрационный номер 0653) в ГБОУ ДПО ИГМАПО Минздрава России по программе ОУ «Бактериология» (от 17.03.2015);
• Кунгурцева Е.А. – Удостоверение о повышении квалификации (регистрационный номер 0810) в ГБОУ ДПО ИГМАПО Минздрава России по программе ОУ «Бактериология» (от 22.03.2014);
• Ракова Е.Б. – Сертификат о повышении квалификации (А № 2965756) (регистрационный номер 971) в Иркутском институте усовершенствования врачей по специальности «Бактериология» (от 04.11.2006);
• Сердюк Л.В. – Сертификат о повышении квалификации (А № 1367810) (регистрационный номер 377) в Иркутском институте усовершенствования врачей по специальности «Бактериология» (от 06.04.2001).

В настоящее время в лаборатории работают следующие сотрудники: Белькова Наталья Леонидовна – руководитель лаборатории, кандидат биологических наук, доцент; Ракова Елена Борисовна – научный сотрудник, кандидат биологических наук; Немченко Ульяна Михайловна – младший научный сотрудник, кандидат биологических наук; Сердюк Людмила Викторовна – инженер, кандидат биологических наук; Бухарова Екатерина Владимировна – младший научный сотрудник; Шабанова Наталья Михайловна – младший научный сотрудник; Кунгурцева Екатерина Александровна – младший научный сотрудник; Москвитина Светлана Геннадьевна – лаборант.